Po terminie
Sekwencjonowanie wysokoprzepustowe metagenomiczne, dzp-23/107/26
Państwowy Instytut Weterynaryjny - Państwowy Instytut Badawczy2 aktualne · 1104 w archiwum·NIP 7160010761·lubelskie
Przedmiot zamówienia
AIPrzedmiotem zamówienia jest usługa sekwencjonowania wysokoprzepustowego metagenomicznego dla 60 próbek RNA/DNA (z możliwością zwiększenia o 50% w ramach prawa opcji).
Zakres prac obejmuje:
- przygotowanie bibliotek;
- sekwencjonowanie na platformie Illumina NovaSeq;
- pełną analizę bioinformatyczną (m.in. filtrowanie danych, wskaźniki różnorodności, skład populacyjny, analizę statystyczną oraz graficzną prezentację wyników);
- dostarczenie wyników wraz z raportem podsumowującym na nośniku danych;
- transport próbek na koszt Wykonawcy;
- wsparcie techniczne dla pracownika Zamawiającego.
Trudność: średnia
Usługa wymaga posiadania specjalistycznego laboratorium (na terenie Europy), doświadczenia w zaawansowanych badaniach metagenomicznych oraz spełnienia restrykcyjnych parametrów jakościowych przy przetwarzaniu materiału biologicznego.
Kryteria wyboru oferty
AIWagi punktowe, według których zamawiający oceni oferty.
- Cena (C): waga 90%
- Termin realizacji (T): waga 10%
- Cena (C): punktowana w odniesieniu do ceny najniższej brutto.
- Termin realizacji (T):
- do 6 tygodni: 0 pkt
- do 5 tygodni: 5 pkt
- do 4 tygodni: 10 pkt
Czerwone flagi
AISygnały, na które warto zwrócić uwagę przed startem.
Termin składania ofert przypada na okres wakacyjny (30 lipca)
Termin w okresie wakacyjnym (lipiec-sierpień) może ograniczać liczbę oferentów ze względu na urlopy.
Kary i sankcje
AI- Wadium: brak
- Zabezpieczenie należytego wykonania umowy: brak
- Kary umowne: szczegółowe zapisy określone we wzorze umowy (Załącznik nr 7 do SWZ)
Pytania i odpowiedzi
6Wyodrębnione z wyjaśnień treści SWZ.
1Zamawiający w warunku udziału w postępowaniu wymaga wykazania wykonania lub wykonywania co najmniej dwóch usług polegających na wykonaniu usługi sekwencjonowania metagenomicznego wraz z przygotowaniem bibliotek i analizą bioinformatyczną w kierunku mikrobiomu, wiriomu oraz składu flory endopasożytniczej.
Czy Zamawiający uzna za spełnienie powyższego warunku doświadczenie zdobyte podczas realizacji projektu badawczego „Mapa Mikrobiomu Polski”, w którym wykonawca był głównym wykonawcą i realizował prace obejmujące przygotowanie bibliotek oraz sekwencjonowanie metagenomiczne, mimo że projekt nie był realizowany jako usługa komercyjna na rzecz zewnętrznego zamawiającego, lecz jako projekt badawczy?
W przypadku odpowiedzi twierdzącej prosimy o potwierdzenie, że doświadczenie takie może zostać wykazane na potwierdzenie spełnienia warunku udziału w postępowaniu, o ile swoim zakresem odpowiada wymaganiom określonym w SWZ.
Zamawiający nie wyraża zgody na uznanie za spełnienie warunku udziału w postępowaniu doświadczenia opisanego w pytaniu. Z przedstawionych informacji wynika, że projekt badawczy „Mapa Mikrobiomu Polski” dotyczył badań flory bakteryjnej jelit człowieka. Nie wykazano natomiast, aby obejmował swoim zakresem wykonanie usługi sekwencjonowania metagenomicznego wraz z przygotowaniem bibliotek i analizą bioinformatyczną w kierunku mikrobiomu, wiriomu oraz składu flory endopasożytniczej, zgodnie z wymaganiami określonymi w SWZ.
2W odniesieniu do par. 4 ust. 1 i 2. Umowy , czy Zamawiający dopuści składanie zamówień poprzez pocztę elektroniczną ze wskazanych przez Zamawiającego adresów e-mail wg ustalonego wzoru formularza zamówienia w formacie docx?
Zamawiający nie wyraża zgody na proponowaną zmianę § 4 ust. 2 projektu umowy. Zamówienia będą składane w sposób określony w projektowanych postanowieniach umowy, tj. poprzez stronę internetową Wykonawcy, z zachowaniem zakresu informacji wskazanych w § 4 ust. 2 umowy.
3Czy Zamawiający dopuści jako dostawę danych na nośniku ich udostępnienie za pośrednictwem serwera SFTP (dostęp przez ssh lub stronę internetową pod wskazanym Zamawiającemu loginem i hasłem)?
Zamawiający nie ma preferencji co do sposobu przekazania danych. Dopuszcza udostępnienie danych za pośrednictwem serwera SFTP (z dostępem przez SSH lub stronę internetową), pod warunkiem zapewnienia Zamawiającemu dostępu do danych.
4Zgodnie z opisem parametrów dostarczanego materiału jakie Zamawiający jest w stanie spełnić (Załącznik nr 1) określona czystość próbki A260/280 = 1.7 ÷ 2.0 nie jest wystarczająca do oceny czystości oraz oceny obecności w próbce DNA. Czy Zamawiający deklaruje również minimalny zakres dla parametru spektrofotometrycznego A260/A230 na poziomie 1.5-2.2?
Zamawiający nie wymaga określenia minimalnej wartości parametru spektrofotometrycznego A260/A230. Na potrzeby badań metagenomicznych podstawowym wymaganym parametrem pozostaje A260/280 określony w Załączniku nr 1 do SWZ.
5W załączniku nr 1 (OPZ) Zamawiający podaje, że materiałem będzie 60 próbek RNA/DNA. Proszę określić ile próbek RNA, a ile próbek DNA przewiduje dostarczyć Zamawiający?
Zamawiający informuje, iż wyizolowana próbka zawiera jednocześnie RNA i DNA
Historia zmian
22.07.2026 — publikacja ogłoszenia
30.07.2026 — upływ terminu składania ofert